一、谁是阙下林的一世祖
据《阙林家谱》载，韬公为阙下始祖、披公为九牧始祖、昌公为游洋始祖，古族谱都是这样称呼的。“始祖”一般会被误认为就是“一世祖”。如果把这三人改为阙下祖、九牧祖、游洋祖，不是就没有这样的歧义吗？
有人认为，林攒开创了阙下林家，他应该算阙下林的一世祖吧。其实，林韬、林攒都不是阙下林一世祖。
九牧林没有以闽林16世林披为一世祖，而以17世苇、藻、著等为一世祖；那么阙下林就自然要以17世林尊为一世祖，游洋林就要以17世林萍为一世祖。这样，韬、披、昌三兄弟的后人才有统一的计世标准，不然，就乱套了。所以《阙林家谱》记载：“尊，阙下一世祖。”
二、九牧三房林著的子嗣
据一部分族谱记载，林著的儿子为林患；还有的说是林凭，元庆元年明经及第，靳州广济县令。但《阙林家谱》等莆田祖谱载：“著，无嗣，以田舍入栖隐寺。”又据《中华姓氏通史•林姓》记载：“林著在任横州刺史时，一心为民，结果病死于任上。据莆田九牧宗谱记载，林著原配夫人方氏，无子嗣。”“但后来有人在续修族谱时，修改了原来的族谱，称：‘著公终横州刺史，以田园舍入栖隐寺。夫人方氏生一子名患，移居横州。’看来，后世尊林著为横州林氏始祖者，当为林著从莆田赴横州任上随行的同宗人员后裔，为纪念林著而以其为横州林氏始祖。”
三、林松为林著嗣子？
据《阙林家谱》载：“松，从堂叔著公任横州不回，今横州村俱是林姓，久远无所稽考”。还有大量的阙林族谱记载：“松，自幼从堂叔著公宦游广西横州不归”，或者“宦游广西横州失传”。但（莆田）《莲峰阙下林氏族谱》等个别族谱却记载，林松为林著的嗣子。不少人认为，说林松是林著的嗣子完全是子虚乌有的杜撰，因为封建社会继嗣有两个原则：长房长孙有独特的地位，一般不出继他人；若出继，也是以长继长。这就是说，林松只能出继给林尊的哥哥当儿子，不能出继给林尊的弟弟当儿子。
四、宋九牧的祖源
网上大量的族谱资料记载，宋九牧是林惟正的后人，世系是：彝谏—惟正—智吉—渥—伋—杞--景渊、景佑等。但《阙林家谱》却记载，宋九牧是林惟肃的后人。这是不是林惟肃派下掠人之美，往自己的脸上贴金呢？如果这部族谱是林惟肃的后人的族谱，完全有这个可能。但《阙林家谱》却是员外房林质后人的族谱，不管是林惟正，还是林惟肃，对于他们，在血缘上都是一样的，并不存在亲疏的关系。这就没有可能把惟正的后人硬接到惟肃身上去。是这部族谱错了，还是其他族谱错了？宋九牧的后人最有发言权。《阙林家谱》中宋九牧上祖的世系是：彝谏—惟肃—知古--沃—伋—杞—景渊、景佑等等。
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